Extend es la versión definitiva de Continuum Shift, que cerraba ésta iteración de la historia. La edición añade pocas mejoras a la segunda versión, modifica algunos modos de juego como el modo legión, que ahora se llama modo Abyss, y se crea el modo Unlimited Mars.

La novedad más relevante del juego es la inclusión de un nuevo personaje, Relius Clover, que desde ésta edición pasaría a ser uno de los más importantes de la saga.

ν-13 ha sido derrotada y Noel ha salvado a Ragna de caer al caldero de Kagatsuchi, cambiando la historia y poniendo fin al ciclo infinito en el que el mundo estaba enfrascado.

Huyendo de lo más profundo de la ciudad jerárquica, cada uno de los personajes va a tratar de abrirse camino en ésta nueva historia, sin embargo, la sombra del recién liberado Yuuki Terumi amenaza el futuro del mundo. Pero alguien más acecha, aliado a Terumi en un oscuro plan para acabar con los mismos dioses.